MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 11012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	AAT	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010718	T	6	6	28	33	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010718	TGT	2	6	59	64	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010718	AT	3	6	138	143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010718	ACA	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010718	TTC	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010718	ATT	2	6	1632	1637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010718	TATAT	2	10	1664	1673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010718	ATTA	2	8	1740	1747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010718	TA	3	6	1746	1751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010718	ATA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010718	ATA	2	6	7549	7554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010718	GAAAA	2	10	7569	7578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010718	GGAAG	2	10	7579	7588	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010718	T	6	6	10055	10060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010718	GTT	2	6	10091	10096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010718	TTC	2	6	10134	10139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010718	ATT	2	6	10167	10172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010718	AT	3	6	10205	10210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010718	GA	3	6	10223	10228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010718	ACA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010718	ACA	2	6	10281	10286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010718	GAAAA	2	10	10298	10307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010718	A	6	6	10304	10309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010718	TCA	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010718	GAT	2	6	10349	10354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010718	AG	3	6	10375	10380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010718	ATT	2	6	10388	10393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010718	AATTGA	2	12	10435	10446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010718	AGG	2	6	10538	10543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010718	GGC	2	6	10571	10576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010718	GCG	2	6	10647	10652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010718	CGA	2	6	10828	10833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010718	GCA	2	6	10902	10907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010718	CGC	2	6	10949	10954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010718	GAA	2	6	10961	10966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010718	GAA	2	6	10998	11003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010718	CAAG	2	8	11020	11027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010718	CAG	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010718	GC	3	6	11104	11109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010718	GGC	2	6	11111	11116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010718	GGA	2	6	11237	11242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010718	CCTTC	2	10	11550	11559	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_010718	GGT	2	6	11574	11579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010718	GTC	2	6	11588	11593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010718	TCGTG	2	10	11597	11606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010718	GGA	2	6	11701	11706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010718	AC	3	6	11752	11757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010718	AC	3	6	11921	11926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010718	CAC	2	6	11936	11941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010718	CCT	2	6	12066	12071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010718	GA	3	6	12130	12135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010718	TTTG	2	8	12147	12154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010718	ACAA	2	8	12177	12184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010718	AC	3	6	12204	12209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010718	AAT	2	6	12215	12220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010718	CT	3	6	12281	12286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010718	A	6	6	12289	12294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010718	GGT	2	6	12355	12360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010718	CCA	2	6	12377	12382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010718	GCCT	2	8	12417	12424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010718	AGG	2	6	12432	12437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010718	CCA	2	6	12462	12467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010718	AGA	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010718	TAA	2	6	12514	12519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010718	AGG	2	6	12546	12551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010718	GAA	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010718	GCG	2	6	12570	12575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010718	GGA	2	6	12719	12724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010718	GCG	2	6	12753	12758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010718	TGC	2	6	12809	12814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010718	GTA	2	6	12828	12833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010718	TCAG	2	8	12842	12849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010718	AGG	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010718	AG	3	6	12902	12907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010718	ACC	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010718	GGGAG	2	10	13076	13085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010718	GTA	2	6	13155	13160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010718	AGC	2	6	13658	13663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010718	CAT	2	6	13664	13669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010718	AAGCA	2	10	13784	13793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010718	GCGA	2	8	13816	13823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010718	A	6	6	13846	13851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010718	CCA	2	6	13852	13857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010718	GA	3	6	13994	13999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010718	CCG	2	6	14016	14021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010718	TGG	2	6	14109	14114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010718	ACC	2	6	14125	14130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010718	GTAGG	2	10	14161	14170	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010718	CCGTA	2	10	14333	14342	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010718	GAG	2	6	14588	14593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010718	CGG	2	6	14634	14639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010718	CAA	2	6	14728	14733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010718	TGAAAT	2	12	14743	14754	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010718	ACC	2	6	14905	14910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010718	CG	3	6	15045	15050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010718	GA	4	8	15083	15090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010718	CGG	2	6	15127	15132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010718	CGT	2	6	15323	15328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010718	GACG	2	8	15402	15409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010718	AGAT	2	8	15550	15557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010718	TAAA	2	8	15677	15684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010718	AGT	2	6	15809	15814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010718	TCC	2	6	15819	15824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010718	T	6	6	15879	15884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010718	TGT	2	6	15888	15893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010718	T	6	6	15893	15898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010718	TAA	2	6	15914	15919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010718	T	9	9	15925	15933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010718	ATT	2	6	15964	15969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010718	AT	3	6	16022	16027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010718	TAAAT	2	10	16032	16041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010718	TAT	2	6	16086	16091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010718	ATG	2	6	16125	16130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010718	ATA	2	6	16176	16181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010718	AAT	2	6	16192	16197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010718	ATT	2	6	17832	17837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010718	T	6	6	17917	17922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010718	A	6	6	17936	17941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010718	TTA	2	6	17942	17947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010718	AAATT	2	10	17948	17957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010718	TAAA	2	8	17968	17975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010718	AGG	2	6	17985	17990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010718	TTA	2	6	20103	20108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010718	ATTTG	2	10	20117	20126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010718	TGA	2	6	20224	20229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010718	TAA	2	6	20250	20255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010718	ACTA	2	8	21454	21461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010718	GTA	2	6	21464	21469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010718	AGG	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010718	ATT	2	6	21497	21502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010718	AGA	2	6	22414	22419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010718	AATCC	2	10	22507	22516	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010718	ATAA	2	8	22526	22533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010718	TCAA	2	8	22564	22571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010718	T	6	6	22623	22628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010718	TAA	2	6	22652	22657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010718	AT	3	6	22694	22699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010718	AG	3	6	22740	22745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010718	GGT	2	6	22748	22753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010718	TGA	2	6	22777	22782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010718	AGT	2	6	22813	22818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010718	AGT	2	6	22820	22825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010718	T	6	6	22921	22926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010718	AAT	2	6	22943	22948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010718	G	6	6	22957	22962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010718	AAT	2	6	22963	22968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_010718	TCCC	2	8	24400	24407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_010718	GA	3	6	24427	24432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010718	CT	4	8	24508	24515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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153	NC_010718	AGG	2	6	24586	24591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_010718	TTA	2	6	25283	25288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010718	T	6	6	25304	25309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010718	TAA	2	6	25313	25318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010718	T	6	6	25969	25974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010718	GTA	2	6	28905	28910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_010718	AACT	2	8	135559	135566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
433	NC_010718	AT	3	6	135626	135631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_010718	CGG	2	6	135643	135648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_010718	CTC	2	6	135659	135664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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